Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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