Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms