Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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LgsnQ8CIX8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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LgsnQ8CIX8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LgsnQ8CIX8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LgsnQ8CIX8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LgsnQ8CIX8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LgsnQ8CIX8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LgsnQ8CIX8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LgsnQ8CIX8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LgsnQ8CIX8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LgsnQ8CIX8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LgsnQ8CIX8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LgsnQ8CIX8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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LgsnQ8CIX8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LgsnQ8CIX8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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