Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Brf1Q8CFK2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Brf1Q8CFK2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Brf1Q8CFK2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Brf1Q8CFK2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Brf1Q8CFK2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Brf1Q8CFK2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf1Q8CFK2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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