Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rdh13Q8CEE7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rdh13Q8CEE7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rdh13Q8CEE7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rdh13Q8CEE7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rdh13Q8CEE7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rdh13Q8CEE7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rdh13Q8CEE7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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