Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms