Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdac7Q8C2B3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdac7Q8C2B3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdac7Q8C2B3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hdac7Q8C2B3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hdac7Q8C2B3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hdac7Q8C2B3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hdac7Q8C2B3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hdac7Q8C2B3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hdac7Q8C2B3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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