Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Snx16Q8C080 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Snx16Q8C080 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Snx16Q8C080 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Snx16Q8C080 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Snx16Q8C080 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Snx16Q8C080 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Snx16Q8C080 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx16Q8C080 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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