Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pggt1bQ8BUY9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Pggt1bQ8BUY9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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