Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp43Q8BUM9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp43Q8BUM9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp43Q8BUM9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp43Q8BUM9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp43Q8BUM9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp43Q8BUM9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp43Q8BUM9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp43Q8BUM9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp43Q8BUM9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp43Q8BUM9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp43Q8BUM9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp43Q8BUM9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp43Q8BUM9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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