Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms