Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg2bQ80XK6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg2bQ80XK6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms