Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

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Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Clec16aQ80U30 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clec16aQ80U30 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clec16aQ80U30 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clec16aQ80U30 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Clec16aQ80U30 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Clec16aQ80U30 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Clec16aQ80U30 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Clec16aQ80U30 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clec16aQ80U30 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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