Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shq1Q7TMX5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms