Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn4bQ7M729 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Scn4bQ7M729 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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