Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tmeff1Q6PFE7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmeff1Q6PFE7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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