Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trim37Q6PCX9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trim37Q6PCX9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim37Q6PCX9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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