Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms