Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Fndc3c1Q6DFV6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms