Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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