Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms