Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms