Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5dQ62240 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms