Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp1Q62209 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms