Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Prkd1Q62101 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Prkd1Q62101 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Prkd1Q62101 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Prkd1Q62101 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prkd1Q62101 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms