Protein–RNA interactions for Protein: Q61718

Ifna15, Alpha-interferon, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna15Q61718 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifna15Q61718 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifna15Q61718 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ifna15Q61718 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ifna15Q61718 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms