Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vsx2Q61412 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms