Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde3bQ61409 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms