Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms