Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cln3Q61124 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cln3Q61124 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cln3Q61124 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cln3Q61124 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cln3Q61124 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cln3Q61124 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cln3Q61124 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cln3Q61124 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms