Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JrkQ60976 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms