Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mkrn3Q60764 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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