Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms