Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rnf123Q5XPI3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rnf123Q5XPI3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rnf123Q5XPI3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rnf123Q5XPI3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf123Q5XPI3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf123Q5XPI3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf123Q5XPI3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf123Q5XPI3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf123Q5XPI3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf123Q5XPI3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf123Q5XPI3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms