Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Utp20Q5XG71 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms