Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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