Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trim38Q5SZ99 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms