Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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