Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Fam220aQ3ZN08 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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Fam220aQ3ZN08 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Fam220aQ3ZN08 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Fam220aQ3ZN08 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Fam220aQ3ZN08 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Fam220aQ3ZN08 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Fam220aQ3ZN08 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Fam220aQ3ZN08 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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