Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn13Q3UW68 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms