Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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