Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms