Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Edc4Q3UJB9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Edc4Q3UJB9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Edc4Q3UJB9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Edc4Q3UJB9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Edc4Q3UJB9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Edc4Q3UJB9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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Edc4Q3UJB9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Edc4Q3UJB9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc4Q3UJB9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Edc4Q3UJB9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Edc4Q3UJB9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Edc4Q3UJB9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Edc4Q3UJB9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Edc4Q3UJB9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Edc4Q3UJB9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Edc4Q3UJB9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Edc4Q3UJB9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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