Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Q3U6N9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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