Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U595 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U595 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U595 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms