Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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