Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms