Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms