Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms