Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Traf3ip1Q149C2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Traf3ip1Q149C2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms